A década de 1990 sinalizou o começo da queda da empresa, que se viu imersa em dívidas e crises financeiras. Em 2005, a companhia solicitou recuperação judicial, e no ano seguinte foi fragmentada em duas partes: uma adquirida pela Gol e a outra pela Volo Brasil. Em 20 de agosto de 2010, a falência da Varig foi oficialmente declarada.
